分子是由組成的原子按照一定的鍵合順序和空間排列而結(jié)合在一起的整體，這種鍵合順序和空間排列關(guān)系稱為分子結(jié)構(gòu)。由于分子內(nèi)原子間的相互作用，分子的物理和化學(xué)性質(zhì)不僅取決于組成原子的種類和數(shù)目，更取決于分子的結(jié)構(gòu)。

分子概念發(fā)展

最早提出比較確切的分子概念的化學(xué)家是意大利阿伏伽德羅，他于1811年發(fā)表了分子學(xué)說(shuō)，認(rèn)為：“原子是參加化學(xué)反應(yīng)的最小質(zhì)點(diǎn)，分子則是在游離狀態(tài)下單質(zhì)或化合物能夠獨(dú)立存在的最小質(zhì)點(diǎn)。分子是由原子組成（構(gòu)成）的，單質(zhì)分子由相同元素的原子組成（構(gòu)成），化合物分子由不同元素的原子組成（構(gòu)成）。在化學(xué)變化中，不同物質(zhì)的分子中各種原子進(jìn)行重新結(jié)合�！�

自從阿伏伽德羅提出分子概念以后，在很長(zhǎng)的一段時(shí)間里，化學(xué)家都把分子看成比原子稍大一點(diǎn)的微粒。1920年，德國(guó)化學(xué)家施陶丁格開(kāi)始對(duì)這種小分子一統(tǒng)天下的觀點(diǎn)產(chǎn)生懷疑，他的根據(jù)是：利用滲透壓法測(cè)得的橡膠的分子量可以高達(dá)10萬(wàn)左右。他在論文中提出了大分子（高分子）的概念，指出天然橡膠不是一種小分子的締合體，而是具有共價(jià)鍵結(jié)構(gòu)的長(zhǎng)鏈大分子。高分子還具有它本身的特點(diǎn)，例如高分子不像小分子那樣有確定不變的分子量，它所采用的是均分子量。

隨著分子概念的發(fā)展，化學(xué)家對(duì)于無(wú)機(jī)分子的了解也逐步深入，例如氯化鈉是以鈉離子和氯離子以離子鍵互相連接起來(lái)的一種無(wú)限結(jié)構(gòu)，很難確切地指出它的分子中含有多少個(gè)鈉離子和氯離子，也無(wú)法確定其分子量，這種結(jié)構(gòu)還包括金剛石、石墨、石棉、云母等分子。

在研究短壽命分子的方法出現(xiàn)以后，例如用微微秒光譜學(xué)研究方法，測(cè)得甲基（CH??）的壽命為10?13秒，不但壽命短，而且很活潑，其原因是甲基的價(jià)鍵是不飽和的，具有單數(shù)電子的結(jié)構(gòu)。這種粒子還有CH?、CN?、HO，它們統(tǒng)稱為自由基，僅具有一定程度的穩(wěn)定性，很容易發(fā)生化學(xué)反應(yīng)，由此可見(jiàn)自由基也具有分子的特征，所以把自由基歸入分子的范疇。還有一種分子在基態(tài)時(shí)不穩(wěn)定，但在激發(fā)態(tài)時(shí)卻是穩(wěn)定的，這種分子被稱為準(zhǔn)分子。從分子水上研究各種自然現(xiàn)象的科學(xué)稱為分子科學(xué)，例如動(dòng)物學(xué)、遺傳學(xué)、植物學(xué)、生理學(xué)等正在掌握各種形式的不同種類分子的性能和結(jié)構(gòu)，由分子的性能和結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)出具有給定性能的分子，這就是所謂分子設(shè)計(jì)。在化學(xué)變化中，分子會(huì)改變，而原子不會(huì)改變。